(1)疱疹性咽峡炎与手足口病都是由肠道病毒感染引起的,主要的病原体均为柯萨奇病毒 A 型(CV-A)和肠道病毒 71 型(EV-71)。与手足口病相比,疱疹性咽峡炎主要表现为咽峡部、口腔黏膜部位的疱疹、溃疡等,病变比较局限,不会出现其他部位皮疹;但手足口病除咽峡部疱疹外,还经常出现手、足、臀部肛周甚至四肢皮肤等部位的皮疹疱疹。需要注意:手足口病早期可仅表现为疱疹性咽峡炎。(2)与呼吸道合胞病毒感染相比,疱疹性咽峡炎的呼吸道症状较轻,甚至缺如,较少出现喘息气促、低氧血症、肺炎等呼吸道合胞病毒感染常见症状。(3)流行性感冒具有明显的季节流行特征,通常在冬春季高发,除发热、咳嗽流涕等上呼吸道感染症状,还可表现为乏力、头痛、肌肉酸痛不适等,全身症状比较明显;而疱疹性咽峡炎春夏季多发,除发热、口咽部疱疹外,一般全身症状较轻微。